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pydicom 2

[pydicom] DICOM 대량 데이터 PACS프로그램에서 확인하기 (FileSet)

👓 들어가기 전 연구 프로젝트를 하다보면 의료원으로부터 대량의 dicom 파일을 전달받을 것이다. 여러 상하위의 폴더 속 파일들이 많은데, PACS 프로그램에서 영상을 확인하기 위해선 path가 저장된 DICOMDIR 파일이 꼭 필요하다. 그렇다보니 pydicom 패키지 속 fileset 클래스의 Fileset 모듈을 사용한다면 된다! 1. os.walk를 통해 상하위 폴더 내 dcm 파일리스트를 확인하고 2. 반복문을 돌려 Fileset에 add를 할 계획임 3. 단, 오류발생을 대비하여 try ~ except 구문을 사용하면서, 그 오류발생 path들만 따로 모아서 txt 파일로 저장시킴 👓 os.walk & os.path.join 데이터 Path 확인하기 dicom 파일셋을 representatio..

[pydicom]Python으로 PACS DICOM 의료 영상 데이터 활용하기

🐍 Pydicom 소개 의료 영상데이터 관련 업무를 한다면, DICOM 형식의 파일을 필연적으로 마주친다. 파이썬을 통한 DICOM을 다룰 때 Pydicom 패키지는 아주 유용한 패키지가 될 것이다. pydicom 패키지를 활용할 때 기본적인 작업들을 소개하려한다. * pydicom 공식문서: https://pydicom.github.io/pydicom/stable/ 🐍 Pydicom 설치 #pip 사용하여 설치방법 pip install pydicom #conda 사용하여 설치방법 conda install -c conda-forge pydicom 🐍 Dicom 데이터 가져오기 예시 데이터가져오기 의료데이터 정보보호에 의해 쉽게 데이터셋을 구할 수 없다면? 걱정말고 pydicom에서 제공하는 예시 데이터셋..

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