코딩하는 간호사

특허 출원 🫠     드디어 특허출원이 완료되었다 !약 2년여간 AI응급의료 관련한 연구를 진행하면서, 내 이름이 발명자로 들어간 특허 출원!총 3건 중 2건이 먼저 출원완료되었고, 나머지 1건도 정리되면 곧 진행할 예정이다보니 올해 3건의 특허 출원의 성과가 완료된다 😀 지금까지 연구를 진행하면서 IRIS에서 연구리스트에 성과가 하나씩 차곡차곡 쌓이는 것도 물론 보람찼지만,이 기쁨은 견줄 수가 없다ㅎ   앞으로는 ? 중장기적인 목표로는 이번 년도부터 심장내과로 분과를 옮기게 되면서 이곳에서도 좋은 성과를 내면서,새로 연구과제도 따고 특허부터 여러 좋은 성과를 얼른 내야겠다. 중단기적인 목표로는 이번 새로운 연구사업을 준비하면서 느낀 건데, 최근 공부하고 있던 CRA 뿐만 아니라 의료기기 RA쪽도 공..

🪐 정의 SAQ(Seattle Angina Questionnaire)는 관상동맥질환 환자의 임상적으로 중요한 5가지 건강 측면을 측정하는 타당하고 신뢰할 수 있는 도구로, 환자의 기능과 삶의 질에 미치는 영향정도를 정량화하기 위해 건강상태를 측정하는 가장 일반적인 설문지입니다. (Spertus JA, Winder JA, Dewhurst TA, et al. Development and evaluation of the Seattle Angina Questionnaire: a new functional status measure for coronary artery disease. J Am Coll Cardiol. 1995;25(2):333-341. doi:10.1016/0735-1097(94)00397-9) ..

👓 들어가기 전 연구 프로젝트를 하다보면 의료원으로부터 대량의 dicom 파일을 전달받을 것이다. 여러 상하위의 폴더 속 파일들이 많은데, PACS 프로그램에서 영상을 확인하기 위해선 path가 저장된 DICOMDIR 파일이 꼭 필요하다. 그렇다보니 pydicom 패키지 속 fileset 클래스의 Fileset 모듈을 사용한다면 된다! 1. os.walk를 통해 상하위 폴더 내 dcm 파일리스트를 확인하고 2. 반복문을 돌려 Fileset에 add를 할 계획임 3. 단, 오류발생을 대비하여 try ~ except 구문을 사용하면서, 그 오류발생 path들만 따로 모아서 txt 파일로 저장시킴 👓 os.walk & os.path.join 데이터 Path 확인하기 dicom 파일셋을 representatio..

🐍 Pydicom 소개 의료 영상데이터 관련 업무를 한다면, DICOM 형식의 파일을 필연적으로 마주친다. 파이썬을 통한 DICOM을 다룰 때 Pydicom 패키지는 아주 유용한 패키지가 될 것이다. pydicom 패키지를 활용할 때 기본적인 작업들을 소개하려한다. * pydicom 공식문서: https://pydicom.github.io/pydicom/stable/ 🐍 Pydicom 설치 #pip 사용하여 설치방법 pip install pydicom #conda 사용하여 설치방법 conda install -c conda-forge pydicom 🐍 Dicom 데이터 가져오기 예시 데이터가져오기 의료데이터 정보보호에 의해 쉽게 데이터셋을 구할 수 없다면? 걱정말고 pydicom에서 제공하는 예시 데이터셋..

이번년도부터 ER에서 CA 팀으로 변경이 되면서, 살짝의 여유가 생긴 지금! 작년까지 ER - CDSS 파트에서 업무를 수행했다면 올해부터는 CA - Clinical Research 업무로 변경되었다. 팀 규모가 커서 그런지 데이터 분석뿐만 아니라, 예측 엔진 파트 등등 전문가들이 있기에 주로 raw 의료데이터를 가공하는 업무를 최근 하고 있다ㅎ 사실 이 팀에서의 main 업무는 CRA 업무이긴한데, 현재 진행 중이거나 진행 예정인 전/후향 임상시험들이 많아서 하나씩 파악하는 중...! 다기관 의료원들과 함께하기도 하고, 큰 규모의 프로젝트들도 여러 개이다보니 꼼꼼히 살펴봐야할 게 한두개가 아니다. 그래도 S/W 의료기기 CRA 업무이다 보니, 일반 의약품 CRA와 살짝 다르긴 하지만 챙겨야 할 서류가 ..

💥오류 발생 최근 팀이 ER에서 CA 파트로 변경이 되면서, 평소 사용했던 고사양 PC가 아닌 사무용 PC에서 사용하게 되었다. 윈도우 10이라니.... 엑셀에서 다중vlookup 수식사용만해도 허덕이는 PC.... 그래서인지 어디서나 잘 설치했었던 jupyter notebook Nbextesion이 되질 않았다. # 평소 사용했던 jupyter notebook 확장자설치 !pip install jupyter_nbextensions_configurator jupyter_contrib_nbextensions !jupyter contrib nbextension install --user !jupyter nbextensions_configurator enable --user 👇👇👇 오류메시지가 빵빵빵!! 👇👇..

대용량 csv 파일 pyarrow로 pandas 전처리 &excel 저장 (feat. 연구 데이터) 의료데이터를 활용한 연구를 하게 되면, 시시각각 변하는 환자들의 상태들을 체크하고 AI 분석을 위해서는 tracking 시계열정보를 활용하게 된다. 그렇다보니, 그 tracking term 기준이 몇 초냐 몇 분이냐에 따라 데이터 용량이 천차만별이겠지만 그래도 대용량 데이터가 수집되었다는 사실은 변하지 않는다. 데이터 마이닝이 나의 main job은 아니지만, tracking time series data를 가명화 처리하는 과정으로 인해 대용량 data에 대해 접하게 되었다. 🍎 문제 상황 문제상황 1_ 가명화 처리를 위해서는 의료원의 가명화 프로그램을 활용해야하는데, 파일 업로드 상황에서는 excel 확..

AWS Cloud Practioner Foundation 합격.... ㅋㅋㅋ 🤣시작하기 전 주저리주저리 오랜만에 근황 끄적끄적 AWS 자격증 스킬트리를 보고 기초부터 따봐야겠다는 생각한 1인 ✋ 2023년이 시작한 지 몇 달이 지난 3월말에서야 드디어 취득하였따. 그동안 연구기획관련 문서 작성으로 몇 달을 일하다가 저번 주부터 여유시간이 생긴김에 빡공한 결과물... ㅋ 드디어 AWS 첫 발걸음을 뗐다...ㅎ 🤣 시험준비 공부 컴공 출신도 아니고... AWS는 진짜 작년에 잠깐 관련도서 훑어본 정도... 지식이려나 그 것도 독학이었다보니 잘못 이해하고 있을까봐 처음부터 무서웠음.. ㅋ 결론부터 말하면 Cloud Practioner 자격증 공부 point = 기출문제 반복 그렇다.. 기출문제 반복해서 푸는 ..

[ifkakao2022] 😮 초거대 AI 기술은 헬스케어에 어떻게 활용될까? 들어가기 전에 " 초거대 AI 기술은 헬스케어에 어떻게 활용될까? " - 카카오브레인 AI기반 헬스케어 사업 및 연구 담당 zeron님 - 발표 페이지링크 : 🖱 클릭 - 발표 자료: 🖱 클릭 🎀 Part 1. 헬스케어 분야 AI 적용사례 1. 의료영상 seg. - 헬스케어 주된 task, 서비스로 자리매김함 → 그 이유: 1) 사람이 보면서 해석이 가능하고, 2) 병변 크기나 형태 등 정략적인 정보를 획득함으로써 치료계획에 도움 - 유넷 기술이 사용됨 - 더 정교한 seg. label을 누가 더 많이 확보하는지 따라서 제품성능 향상의 핵심이 됨 🤔 문제점 1) seg. 그리는 작업은 Dr. 노동집약적 결과물 2) 이전보다 수행..

IT 근무자 지식 업그레이드 (if kakao dev 2022) 작년부터 참석해온 if kakao dev https://if.kakao.com/ if(kakao)dev2022 함께 나아가는 더 나은 세상 if.kakao.com IT 업계 근무 중이라면 카카오 개발자 컨퍼런스는 많은 도움이 될것이다 ㅎ 일단 IT 대기업에서 올해 성과물에 대해서 엿볼 수도 있고, 발표 대부분이 한단계 발전된 응용 결과물인 경우이기 때문이다. 링크를 클릭해서 보면 학교나 책, 검색 등으로 찾을 수 없는 개발자들의 생생한 경험과 노하우들이 담겨 있기 때문이다. 이번 if kakao dev 2022는 22/12/07~22/12/09 3일에 걸쳐서, 카카오의 여러 소속에서 다양한 트랙의 주제로 진행되었다. 🙋‍♀️나처럼 헬스케어 ..